Одни вызывают жёлтую лихорадку, другие — энцефалиты (японский, Сент-Луис); 12 видов передаются клещами (Повассан, Лангат, клещевого энцефалита); у 18 вирусов переносчик не установлен.

Вирус клещевого энцефалита обладает различной степенью устойчивости к тем или иным факторам внешней среды.

Из лабораторных животных наиболее чувствительны к экспериментальному заражению вирусом клещевого энцефалита белые мыши, хлопковые крысы, хомяки, обезьяны, из домашних животных — овцы, козы, поросята, лошади.

Вакцинация обеспечивает надёжную профилактику менингитов и других неврологических осложнений, вызываемых вирусом полиомиелита, кори и эпидемического паротита, а также снижает частоту и тяжесть заболеваний, вызываемых вирусом клещевого энцефалита и ветряной оспы.

Менингит, вызванный вирусом клещевого энцефалита.

Исключением является вирус клещевого энцефалита, передающийся трансмиссивно иксодовыми клещами, реже — алиментарным путём при употреблении в пищу сырого козьего молока или продуктов из него.

Возбудитель прогредиентной формы клещевого энцефалита — тот же вирус клещевого энцефалита, но процесс приобретает персистирующее течение.

Выделенный в природных очагах высоковирулентный штамм «Абсеттаров» вируса клещевого энцефалита обладает высокой нейротропной и висцеротропной активностью.