Это правило означает, что переплата по одному федеральному налогу может быть зачтена в счёт другого федерального налога независимо от того, в бюджеты каких уровней зачисляются суммы этих налогов.

Кассационная инстанция посчитала обоснованным вывод суда первой инстанции, что в рассматриваемом случае, а именно: когда общество самостоятельно задекларировало и уплатило первоначальную сумму налога; самостоятельно представило уточнённые декларации с суммой налога к уменьшению; самостоятельно представляло налоговые декларации за последующие периоды, на основании которых не уплачивало налог в связи с наличием переплаты, — оно (общество) знало об излишней уплате налога с момента представления уточнённых налоговых деклараций с суммой налога к уменьшению (2 февраля 2004 года).

Апелляционная инстанция, отменяя решение суда и принимая по делу новый судебный акт, указала, что в рассматриваемом случае окончательную сумму переплаты общество узнало 31 января 2006 года из акта сверки расчётов, в связи с чем обращение в суд с заявлением 30 августа 2007 года о возврате налога было произведено обществом в пределах трёхлетнего срока исковой давности.

Заявление о возврате переплаты налога было подано в суд 11 сентября 2006 года, то есть в пределах срока исковой давности.

По результатам камеральной проверки уточнённых деклараций налоговым органом было вынесено заключение о возврате переплаты по налогу в сумме 100 425 729, 87 руб.

Общество обратилось 26 июля 2007 года к налоговому органу с заявлением о возврате переплаты налога на имущество предприятий за 2000 — 2003 годы в сумме 100 425 730, 31 руб.

Тот факт, что налогоплательщик узнал о переплате налога после составления им и налоговым органом акта сверки расчётов от 02. 10. 2003, судом был установлен.

Налоговый орган отразил налоговую декларацию за февраль 2007 года в карточке лицевого счёта налогоплательщика вместе с суммой соответствующей переплаты в бюджет.