Микрофлора полости рта представлена многочисленными видами аэробных и анаэробных микроорганизмов, так как для них здесь имеются вполне благоприятные условия — щелочная реакция слюны, наличие пищевых остатков, благоприятная для размножения температура (37 °C).

Разложение целлюлозы, которая в количественном отношении представляет собой один из основных компонентов растительных тканей, осуществляется главным образом высоко специализированными в отношении питания аэробными и анаэробными микроорганизмами.

На первом этапе назначают препараты с антимикробным эффектом, действие которых направлено на снижение количества анаэробных микроорганизмов.

Настой, в котором начали размножаться анаэробные микроорганизмы, приобретает неприятный (гнилостный) запах.

Например, хорошую жидкую подкормку — травяное удобрение, которое по питательности приравнивается к навозной жиже, мы получаем с помощью анаэробных микроорганизмов, а классический рассыпчатый компост для весеннего удобрения почвы — с помощью аэробных.

Так как всегда присутствующие в сточных водах анаэробные микроорганизмы не нуждаются в процессе жизнедеятельности ни в кислороде, ни в солнечном свете, то такой септик может быть герметичным.

При этом было доказано, что в пародонтальных карманах по мере углубления процесса грамотрицательные анаэробные микроорганизмы преобладают над другими видами.

Видовой состав нормофлоры толстого кишечника представлен аэробными и анаэробными микроорганизмами.