Успешное решение поставленной задачи требует от исследователя глубоких знаний о современных методических приёмах иммуноцитохимии, флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии.

Как указывалось выше, в конфокальной лазерной микроскопии изображение всего образца получают путём сканирования.

Квалифицированному специалисту-морфологу для успешного выполнения задач комплексных междисциплинарных исследований уже недостаточно владения только основами общей, частной морфологии и патологии, но требуется также и понимание главных биофизических принципов, лежащих в основе феноменов, используемых при создании приборов, предназначенных для флуоресцентной и конфокальной лазерной микроскопии.

Для облегчения идентификации клеток и тканей, а также для определения положения, формы клеток, их апоптозных изменений, фазы митотического цикла в исследованиях, проводимых с применением лазерной конфокальной микроскопии и обычной флуоресцентной микроскопии, используется окраска ядер клеток соответствующими флуоресцентными красителями.

Например, по изменению FRET-сигнала между G? иG?? субъединицами G-белка, слитыми с флуоресцирующими белками CFP и YFP, можно охарактеризовать динамические характеристики диссоциации G-белка в живых клетках; две субъединицы никотиновых ацетилхолиновых рецепторов ?4 и ?2, слитые с YFP и CFP, послужили основой для разработки клеточных систем, на основе которых с применением спектральной конфокальной микроскопии показана возможность измерять уровень ?4?2-рецепторов и изучать процессы их сборки-диссоциации под воздействием различных стимулов.

Конфокальная микроскопия является разновидностью флуоресцентной микроскопии с улучшенным разрешением вдоль оптической оси объектива, которое достигается за счёт использования принципа конфокальной фильтрации флуоресценции.

Использование лазерной конфокальной микроскопии для изучения объектов, подвергнутых окраске флуоресцентными красителями, даёт возможность определять локализацию специфических молекул и органелл с высокой точностью.

При конфокальной микроскопии данный эффект может быть компенсирован за счёт линейного или покадрового усреднения сканируемых изображений.