Подконтрольность выражается в том, что решения, принятые в порядке таможенного контроля вышестоящими таможенными органами, обязательны для исполнения нижестоящими таможенными органами.
Суть данной формы состоит в использовании принципов субординации, подчинённости и подконтрольности нижестоящих органов исполнительной власти вышестоящим.