Кроме этого, рибосомы присутствуют на внутренней поверхности мембран митохондрий, где также принимают активное участие в синтезе белковых молекул.

Есть мезосомы — внутренние выросты плазматической мембраны, которые считаются функциональными эквивалентами митохондрий эукариот.

Внутренняя мембрана митохондрий содержит так называемые дыхательные ферменты.

Отдельный компартмент (ячейка) представлен какой-либо мембранной органеллой (например, лизосомой) или её частью (кристами, отграниченными внутренней мембраной митохондрий).

Окислительное фосфорилирование или клеточное дыхание происходит, на внутренних мембранах митохондрий, в которые встроены молекулы-переносчики электронов.

Внутренняя мембрана митохондрий почти непроницаема для протонов — они могут проходить только через особые динамические каналы, которые, пропустив протон, захлопываются.

Ферменты, осуществляющие процессы окислительного фосфорилирования, встроены во внутреннюю мембрану митохондрий.